Prof. Dr. Günter Wachendörfer ist Honorarprofessor an der Johann-Wolfgang-Goethe-Universität in Frankfurt a. M. und Lehrbeauftragter an der Justus-Liebig-Universität in Gießen.
Er leitete vom 1. 10. 1985 bis 30. 4. 1992 die Abteilung "Lebensmittelüberwachung, Tierschutz und Veterinärwesen" im Hessischen Ministerium für Jugend, Familie und Gesundheit. Einer der Schwerpunkte seiner Tätigkeit in der Hessischen Veterinärverwaltung war über 15 Jahre der Schafgesundheitsdienst in Nord- und Mittelhessen. Seine wissenschaftliche Arbeit konzentrierte sich auf die Diagnostik und Bekämpfung wirtschaftlich bedeutsamer Krankheiten dieser Tierart sowie der auf den Menschen übertragbaren Krankheiten (Zoonosen).